Исследовательская работа “Филогеография на азиатской части ареала полёвки-экономки (Alexandromys oeconomus, Pallas 1776) по данным полиморфизма гена cytb митохондриальной ДНК”

Данная работа была выполнена на базе и при всесторонней помощи сотрудников лаборатории эволюционной геномики и палеогеномики ЗИН РАН, которые проводят исследования, связанные с изучением филогеографии разных видов полевок на территории России и ближайших регионов.  До настоящего времени сотрудники лаборатории продолжают исследования, позволяющие прояснить эволюционную историю разных видов полевок. В ходе исследований выяснили, что некоторые виды грызунов заселяют Алтае-Саянский регион из разных источников.

Цель: определение филогеографии и генетической структуры полёвки-экономки по данным поморфизма гена cyth мтДНК в Алтае-Саянском регионе.

Задачи:

1. Выделить ДНК из мышечной ткани хвоста животных.
2. Определить варианты нуклеотидных последовательностей и гаплотипы гена cytb A. oeconomus из разных локалитетов.
3. Сравнить наши данные с данными Генбанка.
4. Построить филогенетическое дерево на основе всех образцов гена суть.
5. Провести филогеографический анализ полёвок-экономок на основе данных полиморфизма гена cytb мтДНК.

Гипотеза: Алтае-Саянский регион является местом стыка разных генетических линий полевки-экономки.

Предмет исследования: полиморфизм гена суть мтДНК А. oeconomus.

Объект исследования: нуклеотидные последовательности гена суть мтДНК A. oeconomus севера Монголии (Датхатская котловина).

Методы исследования:

• методы молекулярной биологии (выделение геномной ДНК постановка полимеразной цепной реакции (ПЦР);
• гель-электрофорез;
• молекулярно-филогенетические методы (множественное выравнивание полученных последовательностей, построение филогенетических деревьев).